RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.37□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PRODH2Q9UF12 536 aa11.37□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 Q9Y3F1 56 aa11.37□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCB7O75027 752 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PVRP15151 417 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GRIN2CQ14957 1233 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL15Q96M94 604 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CD8B2A6NJW9 211 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 WDPCPO95876 746 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CD8BP10966 210 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GCH1P30793 250 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF18BQ86Y91 864 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C3orf49Q96BT1 292 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP4K2Q12851 820 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBB3Q13509 450 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB12Q6IQ22 244 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SVOPLQ8N434 492 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SDSLQ96GA7 329 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 DHDHQ9UQ10 334 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF1BP20333 461 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PTAFRP25105 342 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RSU1Q15404 277 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF576Q9H609 170 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FBP2O00757 339 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CNTD1Q8N815 330 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5J2Q8NH18 312 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 THAP4Q8WY91 577 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 BOCQ9BWV1 1114 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0U1RQK1 487 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 DOK2O60496 412 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 APBB3O95704 486 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB36O95755 333 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ITIH1P19827 911 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KCTD7Q96MP8 289 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LCATP04180 440 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C5AR1P21730 350 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SSTP61278 116 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RABL3Q5HYI8 236 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MFSD5Q6N075 450 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LEG1Q6P5S2 330 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 DDIT4LQ96D03 193 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BNC9 293 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MT-ND5P03915 603 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PNMTP11086 282 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CKMT2P17540 419 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CERS1P27544 350 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HERC3Q15034 1050 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CDNFQ49AH0 187 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms