RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR3AQ9H497 397 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 VAPAQ9P0L0 249 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SPASTQ9UBP0 616 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DKK3Q9UBP4 350 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 V9GYQ6 96 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN11A1L157 253 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAT4DA6NG13 374 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LMO7DNF2Z398 122 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD11O00231 422 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FPGTO14772 594 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BCKDKO14874 412 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A6O15403 523 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SGTAO43765 313 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DPM1O60762 260 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKD3O94806 890 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO2B1O94956 709 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE6O95741 557 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL10O95999 233 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA1P01009 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAO1P09471 354 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC159P0C7I6 412 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7A2P14406 83 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AMD1P17707 334 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNA2P20248 432 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FPR1P21462 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RYKP34925 604 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX11P35716 441 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GDF5P43026 501 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PLIN5Q00G26 463 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH1Q08174 1060 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC20Q12834 499 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LAPTM5Q13571 262 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2H3Q13889 308 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 VEZF1Q14119 521 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB39AQ14964 217 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOX1Q15067 660 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR6Q5GH73 641 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK5Q6P3R8 708 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SPESP1Q6UW49 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DPPA4Q7L190 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX19Q8NA77 164 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST14Q8NCH0 376 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BORCS5Q969J3 196 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2E3Q969T4 207 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF566Q969W8 418 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MUS81Q96NY9 551 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS35Q96QK1 796 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HBEGFQ99075 208 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CMKLR1Q99788 373 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ACPTQ9BZG2 426 aa6.69□□□□□ -1.34
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