RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 FAM46BQ96A09 425 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GINS1Q14691 196 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C2orf74A8MZ97 194 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MUSKO15146 869 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SC5DO75845 299 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MT-ND1P03886 318 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CAV3P56539 151 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RRAGCQ9HB90 399 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MTNR1AP48039 350 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.66□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 UPK1BO75841 260 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KCNAB2Q13303 367 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TMEM74Q96NL1 305 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C1orf226A1L170 272 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C8AP07357 584 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 IRF9Q00978 393 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TMEM198Q66K66 360 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NOXA1Q86UR1 476 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PCDH17O14917 1159 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TYRP14679 529 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CDKN2CP42773 168 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CREB5Q02930 508 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF175Q9Y473 711 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PIGVQ9NUD9 493 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 BORCS6Q96GS4 357 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 VNN1O95497 513 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C6orf47O95873 294 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SMPD1P17405 629 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KLHL15Q96M94 604 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MYADMQ96S97 322 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CENPMQ9NSP4 180 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MAP10Q9P2G4 905 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 LMO2P25791 158 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OR7G2Q8NG99 324 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 POC1BQ8TC44 478 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SFXN5Q8TD22 340 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TWNKQ96RR1 684 aa8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NIPSNAP2O75323 286 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 ITGAMP11215 1152 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 GDF10P55107 478 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 MUS81Q96NY9 551 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 GPR137BO60478 399 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 SEC14L2O76054 403 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 GGT1P19440 569 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 CELP19835 753 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 PMS2P3Q13401 168 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 KCNJ8Q15842 424 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 BEST4Q8NFU0 473 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 AIG1Q9NVV5 245 aa8.65□□□□□ -1.03
LRP1-201ENST00000243077 BCHEP06276 602 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms