RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 CA14Q9ULX7 337 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PER3P56645 1201 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 NUP98P52948 1817 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 C5P01031 1676 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CLRN1P58418 232 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 LRP8Q14114 963 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CES4AQ5XG92 561 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 FBXL20Q96IG2 436 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MED11Q9P086 117 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 USP3Q9Y6I4 520 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 H3BSA7 217 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CDRT1O95170 752 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ITGA5P08648 1049 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KCNAB2Q13303 367 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HCKP08631 526 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF84P51523 738 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 POU4F2Q12837 409 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF404Q494X3 552 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SFT2D3Q587I9 215 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 BRF2Q9HAW0 419 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RDH14Q9HBH5 336 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.15■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 IFNA21P01568 189 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 S1PR1P21453 382 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PLOD2O00469 737 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 FGF4P08620 206 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HSD17B1P14061 328 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RORAP35398 523 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 BOCQ9BWV1 1114 aa22.14■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF878C9JN71 531 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CCINQ13939 588 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 C4orf46Q504U0 113 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM107Q6UX40 140 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LNX2Q8N448 690 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DPAGT1Q9H3H5 408 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OR1A2Q9Y585 309 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 FLRT2O43155 660 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SELENOVP59797 346 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SH3BP2P78314 561 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC36A3Q495N2 470 aa22.14■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 A0A0G2JPF8 293 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SYT11Q9BT88 431 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SLC16A8O95907 504 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CLCN2P51788 898 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OR2B6P58173 313 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 TMIEQ8NEW7 156 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CD200R1Q8TD46 325 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 APOC1P02654 83 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF234Q14588 700 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.132e-7■■■□□ 19
TARBP1-201ENST00000040877 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 A0A1B0GVT2 93 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 FEZF1A0PJY2 475 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 E7EQ34 232 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NPIPA2E9PIF3 369 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 CCRL2O00421 344 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 IL33O95760 270 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 OR8K5Q8NH50 307 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 SGTBQ96EQ0 304 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF559Q9BR84 538 aa22.12■■□□□ 1.13
TARBP1-201ENST00000040877 BAIAP2Q9UQB8 552 aa22.12■■□□□ 1.13
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