RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxl4Q8BH70 621 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcmt2Q8BYR1 686 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem200aQ8C817 491 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scamp1Q8K021 338 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Idh3bQ91VA7 384 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sars2Q9JJL8 518 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35a2Q9R0M8 390 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spats1A2RRY8 269 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem215A7E1Z1 235 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgbd5D3YZI9 523 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam46aD3Z5S8 447 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8180E9PXN0 145 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Htr3aP23979 487 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcr4P70658 359 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5113Q3UGK8 141 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tlx2Q61663 284 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf569Q80W31 679 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Yod1Q8CB27 343 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ntmt1Q8R2U4 223 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uckl1Q91YL3 548 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd209aQ91ZX1 238 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prkar1aQ9DBC7 381 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scn8aQ9WTU3 1978 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RbpjlO08674 515 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wnt3P17553 355 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsk3aQ2NL51 490 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10696Q3UTC4 357 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr318Q5NCD7 306 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr677Q8VF06 312 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hhipl2Q9D2G9 717 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhox2dW4VSN9 191 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21865A0A087WRL2 222 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r58G3X9U3 310 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r12G5E8G1 307 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8229K7N749 213 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctla2bP12400 113 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc7a2P18581 657 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stfa2P35174 103 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AboP38649 332 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts8P57110 905 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc106Q3ULM0 279 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtrf1Q8K126 446 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr450Q8VF81 310 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mlc1Q8VHK5 382 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sp7Q8VI67 428 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elmod3Q91YP6 381 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LhppQ9D7I5 270 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam25Q9R159 760 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp383A0A087WRR7 490 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr549E9Q542 316 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NlkO54949 527 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01679 107 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxc5P32043 222 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gng2P63213 71 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk6Q64261 326 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1101Q7TR59 310 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem202Q80W35 275 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Katnb1Q8BG40 658 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcar1Q8C131 343 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sntg1Q925E1 517 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl54Q9CPW3 135 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eef1e1Q9D1M4 174 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DstnQ9R0P5 165 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnpepl1G5E872 720 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HgdO09173 445 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CaskO70589 926 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CntfP51642 198 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ErgP81270 486 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpt1aP97742 773 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tstd2Q3U269 495 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CamkmtQ3U2J5 323 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcho2Q3UQN2 809 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spag8Q3V0Q6 470 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp3r2Q63811 179 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1308Q7TQX0 320 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ostm1Q8BGT0 338 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr26Q8BZA7 337 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MmaaQ8C7H1 415 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1rbQ8CFG9 706 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1278Q8VF39 313 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr850Q8VFF2 315 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr53Q8VGL8 312 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec23bQ9D662 767 aa15.34■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcne2Q9D808 123 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.6 ms