RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 VAPAQ9P0L0 249 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 BTBD17A6NE02 478 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PGRMC2O15173 223 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CTNSO60931 367 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 HLA-DQB2P05538 268 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 UGT2B4P06133 528 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CRYGCP07315 174 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SPI1P17947 270 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MC4RP32245 332 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 AHRP35869 848 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MAGEB1P43366 347 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LBX1P52954 281 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GEMP55040 296 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TNFRSF17Q02223 184 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RPA4Q13156 261 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF559Q9BR84 538 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RHOJQ9H4E5 214 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 HMG20AQ9NP66 347 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 HTTP42858 3142 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GTW7 788 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PPE2 198 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PR64 198 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GSTA4O15217 222 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 AHSGP02765 367 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 BDKRB2P30411 391 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CAPZBP47756 277 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IRF9Q00978 393 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TNK2Q07912 1038 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NFATC3Q12968 1075 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C2orf27AQ580R0 203 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF544Q6NX49 715 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NDUFAF7Q7L592 441 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TRIM69Q86WT6 500 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NSMAFQ92636 917 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TREX1Q9NSU2 369 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 BPTFQ12830 3046 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GIPC1O14908 333 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CREG1O75629 220 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IFNA2P01563 188 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA5P05154 406 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C1SP09871 688 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SBK3P0C264 359 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 COX4I1P13073 169 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZP3P21754 424 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CD40LGP29965 261 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GPR15P49685 360 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IDH3AP50213 366 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ADPRHP54922 357 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ARPP19P56211 112 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 UBE2G2P60604 165 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LCP2Q13094 533 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GK3PQ14409 553 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ATP6AP1Q15904 470 aa7.28□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.28□□□□□ -1.24
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