RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	WLS	Q5T9L3	541 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP21	Q8N119	569 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SARAF	Q96BY9	339 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3GL2	Q99962	352 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DLL4	Q9NR61	685 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MPDZ	O75970	2070 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DOCK7	Q96N67	2140 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CLGN	O14967	610 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PROM1	O43490	865 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	HCN1	O60741	890 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRC1	P31930	480 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MSH2	P43246	934 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	STT3A	P46977	705 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ2	P63252	427 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PDK4	Q16654	411 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGG	Q5H8A4	983 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF175	Q8N4F7	328 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	NUBPL	Q8TB37	319 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EXO5	Q9H790	373 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MED12	Q93074	2177 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NNC1	897 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338		E7ESA3	106 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CES2	O00748	559 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	STK16	O75716	305 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CD1D	P15813	335 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP5	P22003	454 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC1	P48995	793 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL4C	P56559	192 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TGM3	Q08188	693 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CHIT1	Q13231	466 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	E2F2	Q14209	437 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GPSM1	Q86YR5	675 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	BBOF1	Q8ND07	529 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EXT2	Q93063	718 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL20	Q96IG2	436 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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