RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572445.1

PRPF8-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-204ENST00000572445 MISP3Q96FF7 219 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 COG8Q96MW5 612 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 PANX3Q96QZ0 392 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 TMEM140Q9NV12 185 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.91□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.91□□□□□ -1.46
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PRPF8-204ENST00000572445 A0A1B0GUH1 482 aa5.9□□□□□ -1.46
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PRPF8-204ENST00000572445 ABOP16442 354 aa5.9□□□□□ -1.46
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PRPF8-204ENST00000572445 EGR1P18146 543 aa5.9□□□□□ -1.46
PRPF8-204ENST00000572445 CRHR1P34998 444 aa5.9□□□□□ -1.46
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PRPF8-204ENST00000572445 Q9UFV3 132 aa5.9□□□□□ -1.46
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PRPF8-204ENST00000572445 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 A0A1B0GX30 115 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 OR2A25A4D2G3 310 aa5.89□□□□□ -1.47
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PRPF8-204ENST00000572445 VSTM2BA6NLU5 285 aa5.89□□□□□ -1.47
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PRPF8-204ENST00000572445 GSC2O15499 205 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 FOXS1O43638 330 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 BANF1O75531 89 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 SLCO2B1O94956 709 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 CCNDBP1O95273 360 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 SLC16A8O95907 504 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 CATP04040 527 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 STSP08842 583 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 CDH1P12830 882 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 CXCR5P32302 372 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 CA7P43166 264 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF8-204ENST00000572445 AVPR1BP47901 424 aa5.89□□□□□ -1.47
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