RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 RASA2Q15283 850 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 C4orf17Q53FE4 359 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 FRG2Q64ET8 278 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPINK14Q6IE38 97 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPR180Q86V85 440 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 TDRPQ86YL5 185 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR8K3Q8NH51 312 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 TANKQ92844 425 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 NCLNQ969V3 563 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCYL1Q96KG9 808 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 FRG2BQ96QU4 278 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERPINI1Q99574 410 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 HES7Q9BYE0 225 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPCSQ9HAB8 311 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRFN1Q9P244 771 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 PHF11Q9UIL8 331 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPACA6W5XKT8 324 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2CP4-201ENST00000561405 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITPR2Q14571 2701 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP6CO00743 305 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 NME2P1O60361 137 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 LDB3O75112 727 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 SH3BGRLO75368 114 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITGA10O75578 1167 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC25A12O75746 678 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZFAND5O76080 213 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 OTCP00480 354 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV3-11P04433 115 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 GP1BBP13224 206 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 IMPDH1P20839 514 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 NME2P22392 152 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 GALNSP34059 522 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSD17B3P37058 310 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 STT3AP46977 705 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYB561P49447 251 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAP1GDS1P52306 607 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKAA2P54646 552 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 HERVK_113P63132 956 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 STX4Q12846 297 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 UNC50Q53HI1 259 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 C18orf63Q68DL7 685 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDT13Q86X67 352 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 SIAH3Q8IW03 269 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 METTL4Q8N3J2 472 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF721Q8TF20 911 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 RELTQ969Z4 430 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 FRMD6Q96NE9 622 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC77Q9BR77 488 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 BRF2Q9HAW0 419 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYOTQ9UBF9 498 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CACNA1DQ01668 2161 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 NINQ8N4C6 2090 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1W2PR48 441 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERTM1A2A2V5 107 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms