RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543882.5

TM7SF3-215, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 5

Gene TM7SF3, Length 762 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-215ENST00000543882 NUDT13Q86X67 352 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 IQCKQ8N0W5 287 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MREGQ8N565 214 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 BANPQ8N9N5 519 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CCDC63Q8NA47 563 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 AGAP11Q8TF27 550 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 NCLNQ969V3 563 aa7.31□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.31□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 SERPINI1Q99574 410 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MECRQ9BV79 373 aa7.31□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.31□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 STMN3Q9NZ72 180 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 RAB21Q9UL25 225 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PPT2Q9UMR5 302 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 DYTNA2CJ06 578 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC35F4A4IF30 521 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 GABRR3A8MPY1 467 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PGRMC2O15173 223 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PROM1O43490 865 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SEMA3DO95025 777 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 DDAH2O95865 285 aa7.3□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 NR2F6P10588 404 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CPA3P15088 417 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SERPINB3P29508 390 aa7.3□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 PTGER1P34995 402 aa7.3□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 CD96P40200 585 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 HMGCS1Q01581 520 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 STX4Q12846 297 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 LCP2Q13094 533 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TUBA3CQ13748 450 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TLR1Q15399 786 aa7.3□□□□□ -1.24
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TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CCDC153Q494R4 210 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 METTL4Q8N3J2 472 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MDS2Q8NDY4 140 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 METTL6Q8TCB7 284 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 GRHL3Q8TE85 626 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 HAS2Q92819 552 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 TAAR6Q96RI8 345 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CENPKQ9BS16 269 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 ACPTQ9BZG2 426 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 CLMPQ9H6B4 373 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 OXSMQ9NWU1 459 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 MKS1Q9NXB0 559 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PHF11Q9UIL8 331 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 SNX6Q9UNH7 406 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PLLPQ9Y342 182 aa7.3□□□□□ -1.24
TM7SF3-215ENST00000543882 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.3□□□□□ -1.24
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