RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.16□□□□□ -1.1
CLSTN3-212ENST00000541770 HHATQ5VTY9 493 aa8.16□□□□□ -1.1
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CLSTN3-212ENST00000541770 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.15□□□□□ -1.1
CLSTN3-212ENST00000541770 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.15□□□□□ -1.1
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR91A4D1P6 747 aa8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 SGK494L7N484 410 aa8.14□□□□□ -1.11
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CLSTN3-212ENST00000541770 CHRNGP07510 517 aa8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 CYC1P08574 325 aa8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 NEK2P51955 445 aa8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 PLA2G16P53816 162 aa8.14□□□□□ -1.11
CLSTN3-212ENST00000541770 MTTPP55157 894 aa8.14□□□□□ -1.11
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