RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	CHRNB4	P30926	498 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PTGS2	P35354	604 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF460	Q14592	562 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TBCC	Q15814	346 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PDK4	Q16654	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CCT6B	Q92526	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UBE2E3	Q969T4	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NCLN	Q969V3	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CPNE1	Q99829	537 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HPF1	Q9NWY4	346 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAM10	O14672	748 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	STK16	O75716	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ACSL3	O95573	720 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GSTA2	P09210	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	STMN1	P16949	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DNASE1	P24855	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MSX1	P28360	303 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PTGER1	P34995	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR143	P51810	404 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PGGT1B	P53609	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	BIK	Q13323	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	E2F2	Q14209	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	BIVM	Q86UB2	503 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ASB15	Q8WXK1	588 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RND1	Q92730	232 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR22	Q99680	433 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	MYOT	Q9UBF9	498 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	OR14I1	A6ND48	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120		A8MUA0	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120		H0YHG0	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CYR61	O00622	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DYRK3	O43781	588 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CTNS	O60931	367 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	SCEL	O95171	688 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GSTA1	P08263	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC166	P0CW27	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	COX7A2	P14406	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GP5	P40197	560 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CASP2	P42575	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	GDF5	P43026	501 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DGKQ	P52824	942 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ARFIP1	P53367	373 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PLA2G16	P53816	162 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	LIM2	P55344	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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