RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523200.5

TNIP1-217, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP1, Length 1,743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-217ENST00000523200 CST1P01037 141 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ALDH4A1P30038 563 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CDK6Q00534 326 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 FOLH1Q04609 750 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 BNIP3Q12983 259 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SCARB2Q14108 478 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CEBPEQ15744 281 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NKG7Q16617 165 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NRF1Q16656 503 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TMEM64Q6YI46 380 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SLC25A45Q8N413 288 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 MOAP1Q96BY2 351 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CD180Q99467 661 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.93□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TLCD2A6NGC4 264 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 IFNA14P01570 189 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 GLB1P16278 677 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 MAGEA8P43361 318 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 RUNX2Q13950 521 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CBR4Q8N4T8 237 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NCSTNQ92542 709 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF597Q96LX8 424 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SLC29A1Q99808 456 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SOCS2O14508 198 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 GNGT2O14610 69 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SUV39H1O43463 412 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PRSS23O95084 383 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ARAFP10398 606 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF23P17027 643 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 GPR3P46089 330 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SKP1P63208 163 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TP53BP2Q13625 1128 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PLK5Q496M5 336 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CCDC80Q76M96 950 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SPRED1Q7Z699 444 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SFXN5Q8TD22 340 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF681Q96N22 645 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TGM7Q96PF1 710 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 BAG5Q9UL15 447 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.92□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 RASAL1O95294 804 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 AQP1P29972 269 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 MAGEA2P43356 314 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PRR5P85299 388 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 NDUFA9Q16795 377 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SZRD1Q7Z422 152 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 CARFQ8N187 725 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 LZICQ8WZA0 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 C10orf90Q96M02 699 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PDE7BQ9NP56 450 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.91□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 TMEM247A6NEH6 219 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 C5orf58C9J3I9 102 aa14.9□□□□□ -0.02
TNIP1-217ENST00000523200 PDLIM1O00151 329 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms