RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512416.5

SPATA20-222, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 3

Gene SPATA20, Length 845 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-222	ENST00000512416	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	C14orf79	Q96F83	325 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	GPR137	Q96N19	417 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MANBA	O00462	879 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PRRG2	O14669	202 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FFAR3	O14843	346 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	GPR42	O15529	346 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	AHR	P35869	848 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	NEK2	P51955	445 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FRG2	Q64ET8	278 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	LGI4	Q8N135	537 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	GHDC	Q8N2G8	530 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	M1AP	Q8TC57	530 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FRG2B	Q96QU4	278 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	LPAR4	Q99677	370 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF195	O14628	629 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FOXS1	O43638	330 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PDYN	P01213	254 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	HMOX2	P30519	316 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	HYAL2	Q12891	473 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	OR1C1	Q15619	314 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	C3AR1	Q16581	482 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	BEST3	Q8N1M1	668 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	REPS1	Q96D71	796 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MMP25	Q9NPA2	562 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SNX6	Q9UNH7	406 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MEMO1	Q9Y316	297 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	P2RX6	O15547	441 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ASNA1	O43681	348 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	ULK1	O75385	1050 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CRCP	O75575	148 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CLEC3A	O75596	197 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	KRT6A	P02538	564 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	STATH	P02808	62 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	KRT6B	P04259	564 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	CELA2A	P08217	269 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PCNA	P12004	261 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	JAK1	P23458	1154 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	GSTM2	P28161	218 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	PIK3CB	P42338	1070 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	XCR1	P46094	333 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	KRT6C	P48668	564 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	GNGT1	P63211	74 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	IFT88	Q13099	833 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TUBA3C	Q13748	450 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	NSDHL	Q15738	373 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SYT16	Q17RD7	645 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPATA20-222	ENST00000512416	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		12.35	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms