RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MIER2Q8N344 545 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ESX1Q8N693 406 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 FITM2Q8N6M3 262 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 GATA6Q92908 595 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 VPS33AQ96AX1 596 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 FKBP10Q96AY3 582 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MIEF2Q96C03 454 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF681Q96N22 645 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 OR1F2PQ96R84 312 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 DPY30Q9C005 99 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 REEP4Q9H6H4 257 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 THSD1Q9NS62 852 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ZZEF1O43149 2961 aa7.56□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 C1orf226A1L170 272 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IDSB3KWA1 339 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SLC22A3O75751 556 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 LIPCP11150 499 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 COX7A2P14406 83 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 LIFP15018 202 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CAPN3P20807 821 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PIK3R1P27986 724 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ASMTP46597 345 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ATP4BP51164 291 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 C21orf58P58505 322 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SKP1P63208 163 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PLIN5Q00G26 463 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 OCA2Q04671 838 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SLC13A2Q13183 592 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CLN3Q13286 438 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 DNASE1L3Q13609 305 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IL10RAQ13651 578 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MAP7Q14244 749 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 LTB4RQ15722 352 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PGS1Q32NB8 556 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 AGKQ53H12 422 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MED25Q71SY5 747 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ANKRD46Q86W74 232 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 C8orf44Q96CB5 159 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 KLHL29Q96CT2 875 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 TCFL5Q9UL49 500 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IGF2RP11717 2491 aa7.55□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 A8MUA0 341 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CAPN14A8MX76 684 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 C9J4A7 227 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 HRKO00198 91 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 NR5A2O00482 541 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PRMT3O60678 531 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 TBX19O60806 448 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CTNSO60931 367 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ALOX12BO75342 701 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 GPR75O95800 540 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ALBP02768 609 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CT62P0C5K7 136 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 DRD2P14416 443 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PRPS1L1P21108 318 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CD82P27701 267 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 HSD17B7P56937 341 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 STX1BP61266 288 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 RCAN2Q14206 197 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 RPS6KA2Q15349 733 aa7.54□□□□□ -1.2
RAD51B-212ENST00000488612 CEBPEQ15744 281 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms