RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 WASHC5Q12768 1159 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPA4Q13156 261 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 E2F2Q14209 437 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 GRM7Q14831 915 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYTL3Q4VX76 610 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT74Q7RTS7 529 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF567Q8N184 647 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST8SIA2Q92186 375 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 P3H4Q92791 437 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MIEF2Q96C03 454 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C8orf44Q96CB5 159 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELP4Q96EB1 424 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAGED4Q96JG8 741 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OLFM3Q96PB7 478 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FCRL5Q96RD9 977 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOL2Q9BQE5 337 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MUC13Q9H3R2 512 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSL2Q9HCI7 577 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF487B1APH4 448 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C19orf84I3L1E1 186 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 AP3D1O14617 1153 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CST8O60676 142 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANXA9O76027 345 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 WDR47O94967 919 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLDN14O95500 239 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD1EP15812 388 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 EPHA3P29320 983 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP25P42331 645 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NR2C2P49116 596 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIRAPP58753 221 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAC3P60763 192 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 XIAPP98170 497 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLC1Q07866 573 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TFDP2Q14188 446 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRPSAP1Q14558 356 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIR2DS3Q14952 304 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 INAQ16352 499 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3AR1Q16581 482 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TCTE1Q5JU00 501 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNSTQ6PJW8 725 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 COX15Q7KZN9 410 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNX20Q7Z614 316 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELMO1Q92556 727 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 HAS2Q92819 552 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 HAUS1Q96CS2 278 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 VAT1Q99536 393 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABI3Q9P2A4 366 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 TINAGQ9UJW2 476 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3orf18Q9UK00 162 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 BAG5Q9UL15 447 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MED13LQ71F56 2210 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGAP5A6NIR3 686 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 A8MUI8 341 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 H7C0C1 242 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPOPO43791 374 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3G-206ENST00000486357 GUCY1B2O75343 617 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms