RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LUZP2Q86TE4 346 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP5KQ9BT40 448 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 REG4Q9BYZ8 158 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51B5Q9H339 312 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RLIMQ9NVW2 624 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 STUB1Q9UNE7 303 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SSR3Q9UNL2 185 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPT1Q9Y234 373 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GBF1Q92538 1859 aa8.02□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00587B1AMM8 73 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 QSOX1O00391 747 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF18O76093 207 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TOXO94900 526 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 WDPCPO95876 746 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SCG5P05408 212 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA3P12429 323 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRB1P18505 474 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH1Q08174 1060 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ETFDHQ16134 617 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZD3Q86UT5 571 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL23Q86XA0 190 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 RBFAQ8N0V3 343 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52J3Q8NH60 311 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 MYLPFQ96A32 169 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1191Q96A73 305 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf58Q96LI9 332 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 EVPLQ92817 2033 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HYKKA2RU49 373 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PQ18 207 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A3P11169 496 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 STOMP27105 288 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 DOK6Q6PKX4 331 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A8Q8N695 610 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 UCN3Q969E3 161 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 DDIT4Q9NX09 232 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R233 179 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HPGDSO60760 199 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CSO75390 466 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOBTB1O94844 696 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX7O95931 251 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS56P0CW18 603 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SRCP12931 536 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 INSRRP14616 1297 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 SDC2P34741 201 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN2CP42773 168 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 AIF1P55008 147 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA1P56199 1179 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGCS1Q01581 520 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms