RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTCAO00442 366 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CES2O00748 559 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX7A2P14406 83 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNASE1P24855 282 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRC1P31930 480 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STT3AP46977 705 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ2P63252 427 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDK4Q16654 411 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGE2BQ5JRK9 111 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A10Q63ZE4 541 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE3DQ7Z6J8 389 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKMY2Q8IV38 441 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf40Q8IXQ3 194 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35F6Q8N357 371 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXW8Q8N3Y1 598 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf57Q8NEG2 295 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAQR8Q8TEZ7 354 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESAMQ96AP7 390 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBCDQ9BTW9 1192 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A8Q9BY19 250 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOJQ9H4E5 214 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA4P78363 2273 aa12.14□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACANP16112 2415 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC3CA6NJW4 275 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPB2A8KAH6 182 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROM1O43490 865 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF17O60258 216 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK16O75716 305 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCELO95171 688 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3-11P04433 115 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFPL3SP0C7P2 107 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPN2P22792 545 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSH2P43246 934 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCL1P50553 236 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC12A2P55011 1212 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL4CP56559 192 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAPTM5Q13571 262 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPB2Q16082 182 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT1C3Q6IMI6 304 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPD8Q6UX82 237 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULK2Q8IYT8 1036 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA6LQ8N4H0 392 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO36Q8NEA4 188 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGAT2Q96PD7 388 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALPK1Q96QP1 1244 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3GL2Q99962 352 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCMBPQ9BTE3 642 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A15Q9H2J7 730 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP64Q9NPA5 681 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QPCTLQ9NXS2 382 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOCS1Q9NZB8 636 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX12Q9UMY4 172 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDARQ9UNE0 448 aa12.13□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NNC1 897 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT5O00445 386 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYRK3O43781 588 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPORP19235 508 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSR2P43308 183 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLIN5Q00G26 463 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU4F1Q01851 419 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF8Q02556 426 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHIT1Q13231 466 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBCCQ15814 346 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC20BQ86Y33 519 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPSM1Q86YR5 675 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP21Q8N119 569 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIX1Q8N485 282 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC15A4Q8N697 577 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDPRQ8NCN5 879 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAXEQ8NCW5 288 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBOF1Q8ND07 529 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms