RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCLNQ969V3 563 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C19orf60Q96EN9 201 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WDR41Q9HAD4 459 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC151A5D8V7 595 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AIFM1O95831 613 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 F10P00742 488 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GBAP04062 536 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLK1P06870 262 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STT3AP46977 705 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HTR6P50406 440 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ID2Q02363 134 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FOLH1Q04609 750 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF844Q08AG5 666 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TUBA3CQ13748 450 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 INAQ16352 499 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C4orf17Q53FE4 359 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HBEGFQ99075 208 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SENP1Q9P0U3 644 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GABRR3A8MPY1 467 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C17orf105B2RV13 164 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRAMEF2O60811 474 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VPS4BO75351 444 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GPR75O95800 540 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DDAH2O95865 285 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CD96P40200 585 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFAP157Q5JU67 520 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MDS2Q8NDY4 140 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNA7Q96RP8 456 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMC6Q96SB8 1091 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ACPTQ9BZG2 426 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VPS4AQ9UN37 437 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TIMM22Q9Y584 194 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRK2Q5S007 2527 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM13O60858 407 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GUCY1B2O75343 617 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZFAND5O76080 213 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COX7A2P14406 83 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHN1P15882 459 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TNNI3P19429 210 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAPK12P53778 367 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FOXA1P55317 472 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLIN5Q00G26 463 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRT71Q3SY84 523 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OR8K3Q8NH51 312 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC2A12Q8TD20 617 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DGAT2Q96PD7 388 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRMOQ9BU70 441 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ESPL1Q14674 2120 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GLOD5A6NK44 160 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FCHO1O14526 889 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PGRMC2O15173 223 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TYROBPO43914 113 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPAG7O75391 227 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CREB1P16220 341 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GALNSP34059 522 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ASPHQ12797 758 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OR1C1Q15619 314 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms