RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412272.6

HERC4-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-205ENST00000412272 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 DOCK1Q14185 1865 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 BBIP1A8MTZ0 92 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 H7C4K7 107 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 K7ERI5 159 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 M0QZK8 103 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MYL12BO14950 172 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SLC16A4O15374 487 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SUV39H1O43463 412 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 AKR7A3O95154 331 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 GDF11O95390 407 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ANGPTL1O95841 491 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PNLIPP16233 465 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MYL12AP19105 171 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 NT5EP21589 574 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CD200P41217 278 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TSPAN31Q12999 210 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TRAF3Q13114 568 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MED22Q15528 200 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 COQ5Q5HYK3 327 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SYNE4Q8N205 404 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RNF148Q8N7C7 305 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 C19orf18Q8NEA5 215 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SPATA22Q8NHS9 363 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 STOML3Q8TAV4 291 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 FAM84AQ96KN4 292 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 DCSTAMPQ9H295 470 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 OTOFQ9HC10 1997 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 H3BRB1 525 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 NFIBO00712 420 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CHP2O43745 196 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 IFNA6P05013 189 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ZNF44P15621 663 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TSPAN8P19075 237 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SERPINF1P36955 418 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ELK3P41970 407 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CDKN2BP42772 138 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RAB2AP61019 212 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 DEFA5Q01523 94 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MAMLD1Q13495 774 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CAMK2DQ13557 499 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ARHGEF7Q14155 803 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 FAM187BQ17R55 369 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 VPS26BQ4G0F5 336 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 C9orf64Q5T6V5 341 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 LAIR2Q6ISS4 152 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ABHD13Q7L211 337 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.612e-10■■■■■ 28.1
HERC4-205ENST00000412272 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 GJA10Q969M2 543 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RAB24Q969Q5 203 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 MUS81Q96NY9 551 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 NT5C1BQ96P26 610 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 FIZ1Q96SL8 496 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TMEM175Q9BSA9 504 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 ELP3Q9H9T3 547 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 C11orf16Q9NQ32 467 aa5□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CTPS2Q9NRF8 586 aa5□□□□□ -1.61
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HERC4-205ENST00000412272 MUTYHQ9UIF7 546 aa5□□□□□ -1.61
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HERC4-205ENST00000412272 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5□□□□□ -1.61
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HERC4-205ENST00000412272 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 E9PQ18 207 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CA11O75493 328 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PPBPP02775 128 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PF4V1P10720 104 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 PSMB6P28072 239 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 S100A7P31151 101 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 IL5RAQ01344 420 aa4.99□□□□□ -1.61
HERC4-205ENST00000412272 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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