RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DEC1Q9P2X7 70 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0G2JN53 185 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 H7BY64 318 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALT2O60909 372 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 BCHEP06276 602 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ITGA2P17301 1181 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CXCR2P25025 360 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINB10P48595 397 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MAPK12P53778 367 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TUBA1BP68363 451 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ST3GAL4Q11206 333 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CNTN1Q12860 1018 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HSPB3Q12988 150 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LCTLQ6UWM7 567 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TUBA1AQ71U36 451 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PDZD3Q86UT5 571 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 AMZ2Q86W34 360 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MYDGFQ969H8 173 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MTERF3Q96E29 417 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 NLNQ9BYT8 704 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF556Q9HAH1 456 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.57■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PCCBP05166 539 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 UQCRC2P22695 453 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 POU1F1P28069 291 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CTSKP43235 329 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CEP78Q5JTW2 689 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 KRT78Q8N1N4 520 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 AMER3Q8N944 861 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF675Q8TD23 568 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 S100ZQ8WXG8 99 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2E3Q969T4 207 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DYRK4Q9NR20 520 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 WASHC1A8K0Z3 465 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PPM1DO15297 605 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA7AO75326 666 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CCNB2O95067 398 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 KELP23276 732 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 P2RY2P41231 377 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ATAD3BQ5T9A4 648 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 C17orf64Q86WR6 236 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 STX19Q8N4C7 294 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MCFD2Q8NI22 146 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RAD9AQ99638 391 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 SATB2Q9UPW6 733 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 VEGFDO43915 354 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 STATHP02808 62 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HSMCR30P0CW71 290 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ADORA3P0DMS8 318 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DDCP20711 480 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CBLP22681 906 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 BSGP35613 385 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MLIPQ5VWP3 458 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 REEP3Q6NUK4 255 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 PSD2Q9BQI7 771 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 OR51E2Q9H255 320 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 LHX9Q9NQ69 397 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 CDK2AP1O14519 115 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IFNA14P01570 189 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 IFNW1P05000 195 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 MYOGP15173 224 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 GRK3P35626 688 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 HMGA2P52926 109 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 DOC2BQ14184 412 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-201ENST00000325599 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms