RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 USP30Q70CQ3 517 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 RAB8BQ92930 207 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 FRMD6Q96NE9 622 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 NELL2Q99435 816 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 A0A1W2PRB8 838 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SMLR1H3BR10 107 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 BCHEP06276 602 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN19P0C672 248 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 APEX1P27695 318 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 KCNC3Q14003 757 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ERAP2Q6P179 960 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 DEF8Q6ZN54 512 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SLA2Q9H6Q3 261 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MVB12BQ9H7P6 319 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.06■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ALPPP05187 535 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 RPS25P62851 125 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ILKQ13418 452 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 C12orf73Q69YU5 71 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 HORMAD2Q8N7B1 307 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 YIPF7Q8N8F6 280 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 OR56A3Q8NH54 315 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 GNG2P59768 71 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 DSTNP60981 165 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PDE7AQ13946 482 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SYTL3Q4VX76 610 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 FAM71E1Q6IPT2 247 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 XKRXQ6PP77 449 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 OLIG3Q7RTU3 272 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ZNF461Q8TAF7 563 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TM9SF2Q99805 663 aa24.05■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MYL12BO14950 172 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 AKR7A2O43488 359 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TP53P04637 393 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 IL3P08700 152 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TRAPPC2P0DI81 140 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TRAPPC2BP0DI82 140 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 HTR2BP41595 481 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TMEM201Q5SNT2 666 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 CASP12Q6UXS9 341 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 Q6ZVU0 165 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SLC38A5Q8WUX1 472 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ABCG4Q9H172 646 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ADAP00813 363 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MAN2A2P49641 1150 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MEDAGQ5VYS4 303 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PGBD2Q6P3X8 592 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 COMTD1Q86VU5 262 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 PROKR2Q8NFJ6 384 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 OR52I1Q8NGK6 324 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ZNF480Q8WV37 535 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TM9SF4Q92544 642 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 RACGAP1Q9H0H5 632 aa24.04■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 IFNA14P01570 189 aa24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 TBPL1P62380 186 aa24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 SMUG1Q53HV7 270 aa24.03■■□□□ 1.44
SENP3-201ENST00000321337 ZFP41Q8N8Y5 198 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms