RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 B4DXG7 233 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 H7C4K7 107 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 M0R3H8 397 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 URODP06132 367 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KCNA10Q16322 511 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 DUSP7Q16829 419 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 RTP2Q5QGT7 225 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NATD1Q8N6N6 113 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 USP7Q93009 1102 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KATNBL1Q9H079 304 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 IRF3Q14653 427 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OXR1Q8N573 874 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SETD6Q8TBK2 473 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 P2RY12Q9H244 342 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 WDR90Q96KV7 1748 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SRCP12931 536 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MAGEA2P43356 314 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 HNMTP50135 292 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CTBP2P56545 445 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 EID2BQ96D98 161 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF607Q96SK3 696 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 HCN2Q9UL51 889 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 UNCXA6NJT0 531 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 IL3P08700 152 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ALAS2P22557 587 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CSNK1DP48730 415 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 RING1Q06587 406 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GPR50Q13585 617 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 XKRXQ6PP77 449 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ARL9Q6T311 187 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR7G3Q8NG95 312 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NANSQ9NR45 359 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ASF1AQ9Y294 204 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PCM1Q15154 2024 aa14.6□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 DRD5P21918 477 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KIR2DL3P43628 341 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PSPHP78330 225 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FAHD1Q6P587 224 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 Q6ZVU0 165 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 REPS1Q96D71 796 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OPALINQ96PE5 141 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 REEP4Q9H6H4 257 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PDFQ9HBH1 243 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 NUDT15Q9NV35 164 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CSF3P09919 207 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 DGKGP49619 791 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 SSX1Q16384 188 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 F5P12259 2224 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FRS3O43559 492 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.077e-10■□□□□ 10.3
USP25-201ENST00000285679 MBTPS1Q14703 1052 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 REEP3Q6NUK4 255 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 QRFPRQ96P65 431 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.59□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 FABP7O15540 132 aa14.58□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 TSPAN6O43657 245 aa14.58□□□□□ -0.07
USP25-201ENST00000285679 OR7A10O76100 309 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms