RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 NAGSQ8N159 534 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 CADM2Q8N3J6 435 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 LMX1AQ8TE12 382 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 NUDT8Q8WV74 236 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 CITED4Q96RK1 184 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 TTYH2Q9BSA4 534 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 DCSTAMPQ9H295 470 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 ACTR8Q9H981 624 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 QPCTLQ9NXS2 382 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 AASSQ9UDR5 926 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM131Q92545 1883 aa19.34■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 EFCAB9A8MZ26 197 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 E7EQ34 232 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPTL1O95841 491 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 FADS2O95864 444 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 APOA1P02647 267 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 RAP2AP10114 183 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 GNSP15586 552 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 PKLRP30613 574 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 FMO3P31513 532 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 NLGN4XQ8N0W4 816 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM63Q969Q1 353 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 ITCHQ96J02 903 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa19.33■□□□□ 0.69
UBE2B-201ENST00000265339 ZW10O43264 779 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC159P0C7I6 412 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NPPBP16860 134 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ACVR2AP27037 513 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HTR1EP28566 365 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HSD17B2P37059 387 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HTR3AP46098 478 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RAB28P51157 221 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 BNC1Q01954 994 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CDK5R2Q13319 367 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TUBA3EQ6PEY2 450 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SPESP1Q6UW49 350 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB44Q8NCP5 570 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FAM46DQ8NEK8 389 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPTL6Q8NI99 470 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 METTL6Q8TCB7 284 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PPM1MQ96MI6 270 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MMP27Q9H306 513 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SPASTQ9UBP0 616 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 TRPS1Q9UHF7 1281 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RABL2BQ9UNT1 228 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SNX11Q9Y5W9 270 aa19.33■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 VPS13AQ96RL7 3174 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ERVH48-1M5A8F1 160 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GNGT2O14610 69 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SDC3O75056 442 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN9O95484 217 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFS1P28331 727 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CNR2P34972 360 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CTSKP43235 329 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CLK1P49759 484 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MTPNP58546 118 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PLIN5Q00G26 463 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF691Q5VV52 312 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NEIL2Q969S2 332 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPV9 198 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HAT1O14929 419 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CD36P16671 472 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PRKACGP22612 351 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 HTR6P50406 440 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 EMX2Q04743 252 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CHIT1Q13231 466 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 XKR7Q5GH72 579 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RAB42Q8N4Z0 105 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PARP16Q8N5Y8 322 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FNDC5Q8NAU1 212 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PROKR1Q8TCW9 393 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PIGKQ92643 395 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 BRINP2Q9C0B6 783 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 ANKHQ9HCJ1 492 aa19.32■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 B4DGG1 531 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 AP3D1O14617 1153 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 FFAR3O14843 346 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 GPR42O15529 346 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CST1P01037 141 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 CD22P20273 847 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MASP1P48740 699 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 PPP2R2BQ00005 443 aa19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
UBE2B-201ENST00000265339 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms