RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CREG1O75629 220 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TIPRLO75663 272 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 KCNK5O95279 499 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 RETP07949 1114 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FCGR1AP12314 374 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MYF5P13349 255 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CSF2RBP32927 897 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ARL4DP49703 201 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SHC2P98077 582 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 VAC14Q08AM6 782 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 LPAL2Q16609 132 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 LPCAT4Q643R3 524 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SPRED1Q7Z699 444 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PTOV1Q86YD1 416 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PDSS2Q86YH6 399 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 LILRA2Q8N149 483 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CSF3RQ99062 836 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SEPHS2Q99611 448 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CAPN10Q9HC96 672 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PSME2Q9UL46 239 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SPTBP11277 2137 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 USP34Q70CQ2 3546 aa7.84□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 RDH16O75452 317 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SERPINA1P01009 418 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SYPP08247 313 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 ETFAP13804 333 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 PNLIPP16233 465 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 PCGF2P35227 344 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 GABRA4P48169 554 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SEPHS1P49903 392 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 MVDP53602 400 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 EMP3P54852 163 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CASP9P55211 416 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 RAB38P57729 211 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 DSTNP60981 165 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CHRNB3Q05901 458 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 TP53BP2Q13625 1128 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 RUNX2Q13950 521 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 TCTE1Q5JU00 501 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 COX20Q5RI15 118 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SAXO2Q658L1 398 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CA13Q8N1Q1 262 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 FAM110BQ8TC76 370 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SFXN5Q8TD22 340 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 NEURL3Q96EH8 262 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 RNF145Q96MT1 663 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 KCNK17Q96T54 332 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 TRIM4Q9C037 500 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 CPED1A4D0V7 1026 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.83□□□□□ -1.16
COPS4-201ENST00000264389 SGK494L7N484 410 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms