RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ISM1B1AKI9 464 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GBAP04062 536 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CCL5P13501 91 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LHCGRP22888 699 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TCEA2Q15560 299 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AAK1Q2M2I8 961 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HSDL2Q6YN16 418 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FCRL1Q96LA6 429 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WDR26Q9H7D7 661 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM170BA6NMN3 283 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0355O15063 1070 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC19A2O60779 497 aa8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 SNX4O95219 450 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GPR89BP0CG08 455 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CTSCP53634 463 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LGALS3BPQ08380 585 aa8.44□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 GINS1Q14691 196 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DHCR24Q15392 516 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CTF1Q16619 201 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LAS2Q8IYD9 372 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WDR48Q8TAF3 677 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DNASE1L2Q92874 299 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 COQ7Q99807 217 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR51I1Q9H343 314 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C6P13671 934 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HLA-EP13747 358 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCMT1P22061 227 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 HBA1P69905 142 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZXDBP98169 803 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GAREM2Q75VX8 874 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NACC2Q96BF6 587 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NT5DC2Q9H857 520 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 RHCGQ9UBD6 479 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 ADORA3P0DMS8 318 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AQP6Q13520 282 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IL18Q14116 193 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TRAM1Q15629 374 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NUDT8Q8WV74 236 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DIABLOQ9NR28 239 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HCN2Q9UL51 889 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 ORC5O43913 435 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADH1BP00325 375 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FHP07954 510 aa8.43□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZBP1Q9H171 429 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TPK1Q9H3S4 243 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IL21Q9HBE4 155 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ING4Q9UNL4 249 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PATJQ8NI35 1801 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN11A1L157 253 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM172BPA6NC97 362 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA12O60330 932 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MAGP20916 626 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MMP12P39900 470 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 XCR1P46094 333 aa8.42□□□□□ -1.06
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