RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 IFNA16P05015 189 aa8.64□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 CDH3P22223 829 aa8.64□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 GPR18Q14330 331 aa8.64□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.64□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.64□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 PMEPA1Q969W9 287 aa8.64□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 M0R3G1 203 aa8.63□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.62□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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CKAP2-201ENST00000258607 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 ARNTLO00327 626 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 QSOX1O00391 747 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 LILRB5O75023 590 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 THEGLP0DJG4 465 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 GPR4P46093 362 aa8.62□□□□□ -1.03
CKAP2-201ENST00000258607 TGM4P49221 684 aa8.62□□□□□ -1.03
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