RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 XKR5Q6UX68 686 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F21O95013 312 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MYF6P23409 242 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DNASE1P24855 282 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GSK3BP49841 420 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF8P60827 252 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FRZBQ92765 325 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM74Q96NL1 305 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 DHDHQ9UQ10 334 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 MST1RQ04912 1400 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C1RP00736 705 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CDK15Q96Q40 435 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RGPD5Q99666 1765 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR1F1O43749 312 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CSF1P09603 554 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CKMT2P17540 419 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ8Q15842 424 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CEP68Q76N32 757 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLAMF9Q96A28 289 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MRIQ9BWK5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CPED1A4D0V7 1026 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A6NHS1 94 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MBLAC2Q68D91 279 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GPR137BO60478 399 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SNAP29O95721 258 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SDHBP21912 280 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 SRPXP78539 464 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 IQCHQ86VS3 1027 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TNFSF9P41273 254 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PPT1P50897 306 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PER3P56645 1201 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IRF9Q00978 393 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TLE4Q04727 773 aa6.72□□□□□ -1.33
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