RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 REPS1Q96D71 796 aa7.37□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MS4A14Q96JA4 679 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 BMFQ96LC9 184 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TRIB3Q96RU7 358 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ABHD1Q96SE0 405 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.37□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 CARD9Q9H257 536 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CD84Q9UIB8 345 aa7.37□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC4A1P02730 911 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TFP02787 698 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PCCBP05166 539 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CA4P22748 312 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC15A1P46059 708 aa7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 COLEC12Q5KU26 742 aa7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC66Q68CR7 880 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 KDELC1Q6UW63 502 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAM47BQ8NA70 645 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 STARD5Q9NSY2 213 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.36□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PQ67 120 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 OR2A25A4D2G3 310 aa7.35□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.35□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 ETS1P14921 441 aa7.35□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 HOXA5P20719 270 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 AVPR1BP47901 424 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PMS2P54278 862 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MFAP4P55083 255 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC18A2Q05940 514 aa7.35□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAM153CQ494X1 144 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 GUSBP11Q6P575 273 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 PARGQ86W56 976 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TDRPQ86YL5 185 aa7.35□□□□□ -1.23
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