RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNW1P05000 195 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEACAM5P06731 702 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TFPTP0C1Z6 253 aa15.67■□□□□ 0.1
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGFLR1Q9H665 355 aa15.67■□□□□ 0.1
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.66■□□□□ 0.1
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.65■□□□□ 0.1
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COLEC12Q5KU26 742 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PARM1Q6UWI2 310 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLD3Q8IV08 490 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC103Q8IW40 242 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FGF14Q92915 247 aa15.65■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYDGFQ969H8 173 aa15.65■□□□□ 0.1
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