RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB3Q13509 450 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 INSL6Q9Y581 213 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 MT-ND2P03891 347 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.49■□□□□ 0.87
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