RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577646.5

RARA-208, Transcript of retinoic acid receptor alpha, human

TSL 5

Gene RARA, Length 733 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RARA-208	ENST00000577646	ASMT	P46597	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	OLR1	P78380	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	OCRL	Q01968	901 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	EXT1	Q16394	746 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	XKR7	Q5GH72	579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646		Q6ZSR9	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	LPAR4	Q99677	370 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ATM	Q13315	3056 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646		A0A1W2PR48	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	HDAC3	O15379	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	DYRK3	O43781	588 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TMPRSS11D	O60235	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PCDH7	O60245	1069 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	DNAJB6	O75190	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	JRK	O75564	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TGDS	O95455	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	GPR75	O95800	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	LINC00032	P0C843	101 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	NR2F6	P10588	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	OR4D2	P58180	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	STX4	Q12846	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	NR6A1	Q15406	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	C19orf60	Q96EN9	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	APIP	Q96GX9	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	HBEGF	Q99075	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SERPINA7	P05543	415 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	FURIN	P09958	794 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PRPS2	P11908	318 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	COX7A2	P14406	83 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	EMX2	Q04743	252 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	TBR1	Q16650	682 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RARA-208	ENST00000577646	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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