RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NARF	Q9UHQ1	456 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	B9D1	Q9UPM9	204 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PP11	408 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM89	A2RUT3	159 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GSAP	A4D1B5	854 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS46	E5RG02	174 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4D	F5H284	164 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN5	O00501	218 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF197	O14709	1029 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM12	O43184	909 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF208	O43345	1280 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LDB2	O43679	373 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ITM2A	O43736	263 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINI2	O75830	405 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FLOT1	O75955	427 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DFFB	O76075	338 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UFL1	O94874	794 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX30	O94993	753 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA7	O95182	113 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CPNE6	O95741	557 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	WDPCP	O95876	746 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GLUD1	P00367	558 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA1	P02708	482 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAF1	P04049	648 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYGC	P07315	174 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SP9	P0CG40	484 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A8	P0DMV1	189 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A9	P0DMV2	189 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NEFH	P12036	1026 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF2	P14316	349 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKACA	P17612	351 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MX1	P20591	662 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GNLY	P22749	145 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX7	P23759	505 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CD1B	P29016	333 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDX2	P32119	198 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AVPR1A	P37288	418 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYK	P43405	635 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR3A3	P47888	321 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2C2	P49116	596 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC11A1	P49279	550 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GLUD2	P49448	558 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STAR	P49675	285 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFSF10	P50591	281 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCN4	P51793	760 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AP3M2	P53677	418 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NAPA	P54920	295 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN8	P56748	225 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K7CL	P57077	242 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GABPA	Q06546	454 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRDN	Q13061	729 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAF3	Q13114	568 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DRP2	Q13474	957 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VEZF1	Q14119	521 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF3	Q5VWG9	929 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf63	Q68DL7	685 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RGMB	Q6NW40	437 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FJX1	Q86VR8	437 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKFN1	Q8N957	763 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP25	Q8TEE9	199 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC107	Q8WV48	283 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OSTF1	Q92882	214 aa		2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms