RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 BBS5Q8N3I7 341 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLKLQ8NB16 471 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8K5Q8NH50 307 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MR1Q95460 341 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLYATL1Q969I3 302 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUP85Q9BW27 656 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NT5MQ9NPB1 228 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF7Q9UBF6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.06□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5K3A6NET4 321 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRTM2O43300 516 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFSD11O43934 449 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMP2P08253 660 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 STSP08842 583 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCF4P15884 667 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPH2P23942 346 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF10Q5QP82 559 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNMB4Q86W47 210 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIB3Q96RU7 358 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZWILCHQ9H900 591 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMACRQ9UHK6 382 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHKBQ9Y259 395 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKP3Q9Y446 797 aa8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NL46 340 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS44E7EML9 344 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 KMOO15229 486 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPSAP2O60256 369 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALPPP05187 535 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-DQB2P05538 268 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHN1P15882 459 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CA5AP35218 305 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINB6P35237 376 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCK1P35558 622 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL4CP56559 192 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE1BQ01064 536 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 GALNT2Q10471 571 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB43Q86YS6 212 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR26Q8NDV2 337 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPM1MQ96MI6 270 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 VPS35Q96QK1 796 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGPAT1Q99943 283 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 POMT2Q9UKY4 750 aa8.04□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 B9A039 149 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BMH7 237 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTX2O75431 263 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 TK1P04183 234 aa8.03□□□□□ -1.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms