RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 C10orf107Q8IVU9 208 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TBC1D19Q8N5T2 526 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ANKRD53Q8N9V6 530 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TM4SF19Q96DZ7 209 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa12.94□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 LRFN1Q9P244 771 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 RNF6Q9Y252 685 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 IDSB3KWA1 339 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 P2RX6O15547 441 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 UGDHO60701 494 aa12.93□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 EMP2P54851 167 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CDH13P55290 713 aa12.93□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 TRAF3Q13114 568 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 LAPTM5Q13571 262 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TUBA3CQ13748 450 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TTMPQ5BVD1 217 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 PAGE2BQ5JRK9 111 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 LIPMQ5VYY2 423 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 LIPJQ5W064 366 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 GRHL2Q6ISB3 625 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TUBA3EQ6PEY2 450 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 KRT78Q8N1N4 520 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CSNK1A1LQ8N752 337 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 L3MBTL4Q8NA19 623 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MDS2Q8NDY4 140 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 OR52B6Q8NGF0 335 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SUN3Q8TAQ9 357 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ARSGQ96EG1 525 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 ACTR8Q9H981 624 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 JMJD1CQ15652 2540 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 RTTNQ86VV8 2226 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TMEM120BA0PK00 339 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 HYKKA2RU49 373 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 E9PLN8 166 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 PPP6CO00743 305 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TXNDC9O14530 226 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TRIM13O60858 407 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CLDN9O95484 217 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MLYCDO95822 493 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 BPGMP07738 259 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 DHRS4L1P0CG22 281 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TSPAN8P19075 237 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MSX1P28360 303 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 HNF4AP41235 474 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 MEOX1P50221 254 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CCNG1P51959 295 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 EMP3P54852 163 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 DLX5P56178 289 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 NAA20P61599 178 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 OCA2Q04671 838 aa12.92□□□□□ -0.34
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CS-231ENST00000552222 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 HKDC1Q2TB90 917 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 FRMD7Q6ZUT3 714 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ASPGQ86U10 573 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 LAS2Q8IYD9 372 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CCNYL1Q8N7R7 359 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TTLQ8NG68 377 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 TRPC4APQ8TEL6 797 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SLC13A3Q8WWT9 602 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 ATP6V1E2Q96A05 226 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-231ENST00000552222 SEC16BQ96JE7 1060 aa12.92□□□□□ -0.34
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