RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR8K3	Q8NH51	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	GPR78	Q96P69	363 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936		E9PLN8	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PRRG2	O14669	202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	FGF17	O60258	216 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	KLHL2	O95198	593 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	CLDN14	O95500	239 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SOX3	P41225	446 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RNF4	P78317	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ID2	Q02363	134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SLAMF1	Q13291	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RGMA	Q96B86	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936		A0A096LPK6	155 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PLPP1	O14494	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	TUBB4A	P04350	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PTGS2	P35354	604 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	STT3A	P46977	705 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ARFIP1	P53367	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SCYL1	Q96KG9	808 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936		H0YIV9	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PROM1	O43490	865 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	UGDH	O60701	494 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PDE9A	O76083	593 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	GFAP	P14136	432 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	CNR1	P21554	472 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	TYK2	P29597	1187 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PTGER4	P35408	488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	BIK	Q13323	160 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	GTF2H2	Q13888	395 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-229	ENST00000551936	PIGG	Q5H8A4	983 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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