RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 NUDT13Q86X67 352 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 FCRL1Q96LA6 429 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 MAGEB18Q96M61 343 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CSF3RQ99062 836 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 VCX3BQ9H321 246 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2W5A6NFC9 320 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CHEK2O96017 543 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 FOLR3P41439 243 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 BTKQ06187 659 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SSPNQ14714 243 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 UGT8Q16880 541 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 C7orf26Q96N11 449 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 OCEL1Q9H607 264 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SCOCQ9UIL1 159 aa11.98□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PR48 441 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 IDSB3KWA1 339 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 K7ENP7 123 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PROM1O43490 865 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 RGS14O43566 566 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SNX3O60493 162 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SPIN4Q56A73 249 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR180Q86V85 440 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CCT7Q99832 543 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR70Q9NW82 654 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 C3orf18Q9UK00 162 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ACACBO00763 2458 aa11.97□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF195O14628 629 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CYC1P08574 325 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 MMP11P24347 488 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 EMP2P54851 167 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 BTG2P78543 158 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 TMED1Q13445 227 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 IMPG1Q17R60 797 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 BROXQ5VW32 411 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM205Q6UW68 189 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 DDIASQ8IXT1 998 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 UCN3Q969E3 161 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 CRB3Q9BUF7 120 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf109Q9NX04 203 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.96□□□□□ -0.49
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PQ72 361 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 SOCS6O14544 535 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 B4GALT2O60909 372 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 PEX11AO75192 247 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR35P0CG20 571 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 GSTT1P30711 240 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 HK2P52789 917 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 UCNP55089 124 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 C18orf63Q68DL7 685 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 MAVSQ7Z434 540 aa11.96□□□□□ -0.5
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms