RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAGP10523 405 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LAMP1P11279 417 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 F3P13726 295 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYP11B1P15538 503 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CELP19835 753 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZP3P21754 424 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CALML3P27482 149 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACVR1BP36896 505 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 EVCP57679 992 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 RALGDSQ12967 914 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 GIT2Q14161 759 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACAD10Q6JQN1 1059 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTC27Q6P3X3 843 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHST9Q7L1S5 443 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TEX26Q8N6G2 289 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 Q8N9W7 124 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CLEC1AQ8NC01 280 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNRF1Q8ND25 227 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MDS2Q8NDY4 140 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKRD49Q8WVL7 239 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LIPHQ8WWY8 451 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEPT1Q8WYJ6 367 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PROX1Q92786 737 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 C19orf24Q9BVV8 132 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACTL8Q9H568 366 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 EQTNQ9NQ60 294 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MIEF1Q9NQG6 463 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TXNDC16Q9P2K2 825 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBQLN2Q9UHD9 624 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF221Q9UK13 617 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ERVW-1Q9UQF0 538 aa0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PARD3Q8TEW0 1356 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM186AA6NE01 2351 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ACEP12821 1306 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 FBN2P35556 2912 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 REV3LO60673 3130 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CASTOR2A6NHX0 329 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LMO7DNF2Z398 122 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 BBOX1O75936 387 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZCCHC18P0CG32 403 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SP9P0CG40 484 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MYL6BP14649 208 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDGFRAP16234 1089 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MPZP25189 248 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 UGT1A3P35503 534 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSMD8P48556 350 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARHGDIAP52565 204 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDH8P55286 799 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CXCL9Q07325 125 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 UNC119Q13432 240 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRB14Q14449 540 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 NPTX1Q15818 432 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBBP7Q16576 425 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAF9Q16594 264 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF528Q3MIS6 628 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 IQCCQ4KMZ1 466 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 C5orf47Q569G3 176 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TEX38Q6PEX7 206 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 DHRS11Q6UWP2 260 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM110Q86TL2 294 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF695Q8IW36 515 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 FBXW8Q8N3Y1 598 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRSS35Q8N3Z0 413 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 BBS1Q8NFJ9 593 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMARCD2Q92925 531 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZUFSPQ96AP4 578 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC34Q96HJ3 373 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDRT15Q96T59 188 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 NICN1Q9BSH3 213 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ISCA1Q9BUE6 129 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 MMP27Q9H306 513 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PTGES2Q9H7Z7 377 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDH20Q9HBT6 801 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 PLAGL1Q9UM63 463 aa0.19□□□□□ -2.38
IGKV1-22-201ENST00000524313 SCML2Q9UQR0 700 aa0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms