RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PLAC1Q9HBJ0 212 aa2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP45Q9UL16 551 aa2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PALLDQ8WX93 1383 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NKX6-3A6NJ46 265 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 E9PI62 339 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 H0YC42 278 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 H0YIV9 168 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SOCS6O14544 535 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SYT7O43581 403 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL41O60662 606 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LDB3O75112 727 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFA7O95182 113 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CYP1A2P05177 515 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TFAP2AP05549 437 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TPM3P06753 285 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TOP1P11387 765 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CALB2P22676 271 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PSMA2P25787 234 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RDXP35241 583 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ACADVLP49748 655 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MXI1P50539 228 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CD81P60033 236 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TRDNQ13061 729 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NME3Q13232 169 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MTX1Q13505 466 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FHL2Q14192 279 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 WBP2NLQ6ICG8 309 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NIPAL3Q6P499 406 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD49Q8WVL7 239 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GLYATL1Q969I3 302 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RAB39BQ96DA2 213 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SENP8Q96LD8 212 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FAM20AQ96MK3 541 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC77Q9BR77 488 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KLK15Q9H2R5 256 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CLSTN2Q9H4D0 955 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TLE6Q9H808 572 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HPS4Q9NQG7 708 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OSER1Q9NX31 292 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL9Q9P2J3 617 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 THEGQ9P2T0 379 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SPACA6W5XKT8 324 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LAMB2P55268 1798 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KCPQ6ZWJ8 1503 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS46E5RG02 174 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 H0YIG0 161 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FOXN1O15353 648 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNHIT1O43257 154 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C1QL1O75973 258 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF853P0CG23 659 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 STAG3L1P0CL83 205 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HOXB2P14652 356 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DPEP1P16444 411 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CYP2F1P24903 491 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 AHRP35869 848 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MNDAP41218 407 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PROK1P58294 105 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP10-9P60411 292 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GPR18Q14330 331 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TAF13Q15543 124 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CARTPTQ16568 116 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CAVIN4Q5BKX8 364 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF311Q5JNZ3 666 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C10orf25Q5T742 122 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TTC27Q6P3X3 843 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OLFML1Q6UWY5 402 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZSV7 163 aa2.06□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa2.06□□□□□ -2.08
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