RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504295.1

COPB2-204, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene COPB2, Length 3,524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-204ENST00000504295 DPPA4Q7L190 304 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 LYPD6Q86Y78 171 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 UPRTQ96BW1 309 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CMTM3Q96MX0 182 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FRG2BQ96QU4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 APOL4Q9BPW4 351 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 MED10Q9BTT4 135 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CIPCQ9C0C6 399 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 NEK6Q9HC98 313 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 EXD2Q9NVH0 621 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SNX7Q9UNH6 387 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.06□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 C2orf81A6NN90 581 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 PLK4O00444 970 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FGF18O76093 207 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 MT-CO1P00395 513 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 GASTP01350 101 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 URODP06132 367 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 IL7P13232 177 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 OR1G1P47890 313 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SPINT3P49223 89 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SLC11A1P49279 550 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 P2RX3P56373 397 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 COPZ1P61923 177 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 E2F1Q01094 437 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 HMGCS1Q01581 520 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DPTQ07507 201 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DMPKQ09013 629 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DMWDQ09019 674 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 BAMBIQ13145 260 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SLC13A2Q13183 592 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 GGTLC2Q14390 218 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FHL5Q5TD97 284 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CDH24Q86UP0 819 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ANKRD46Q86W74 232 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 IGSF21Q96ID5 467 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 OR52E6Q96RD3 313 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 HBEGFQ99075 208 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SEPHS2Q99611 448 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TTPALQ9BTX7 342 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CFL2Q9Y281 166 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 C4orf51C9J302 202 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 PSMD11O00231 422 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 IGF2P01344 180 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 OR1E1P30953 314 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 AKT1P31749 480 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 MAPK8P45983 427 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 MAPK9P45984 424 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 OMPP47874 163 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 HBA1P69905 142 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TIGD6Q17RP2 521 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 PLK5Q496M5 336 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TMEM215Q68D42 235 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.05□□□□□ -1.44
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COPB2-204ENST00000504295 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 FEVQ99581 238 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 GPR83Q9NYM4 423 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 SNX6Q9UNH7 406 aa6.05□□□□□ -1.44
COPB2-204ENST00000504295 ASB4Q9Y574 426 aa6.05□□□□□ -1.44
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