RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	TLE3	Q04726	772 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	GAB1	Q13480	694 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RUNX2	Q13950	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	UGCG	Q16739	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FIG4	Q92562	907 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SEPT8	Q92599	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CLPB	Q9H078	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TLR4	O00206	839 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	PRY	O14603	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF197	O14709	1029 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	GYG2	O15488	501 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	AKR7A2	O43488	359 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	DCX	O43602	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	CYTH3	O43739	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	ACSL4	O60488	711 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	FKBP6	O75344	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	BCL10	O95999	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	LCAT	P04180	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	PRKCG	P05129	697 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	IRF1	P10914	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	PEPD	P12955	493 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	MMP9	P14780	707 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	EPHB2	P29323	1055 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	CRABP2	P29373	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	FOXN2	P32314	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTN4-215	ENST00000491592	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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