RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491153.1

KDM5B-208, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5B, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-208ENST00000491153 NME2P22392 152 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 HSD3B2P26439 372 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 HSD17B3P37058 310 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 STT3AP46977 705 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 PER3P56645 1201 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TNFRSF17Q02223 184 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 IFT88Q13099 833 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TRAF3Q13114 568 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 C4orf17Q53FE4 359 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SPINK14Q6IE38 97 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 HSDL2Q6YN16 418 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 NUDT13Q86X67 352 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 HOMEZQ8IX15 550 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 AMER2Q8N7J2 671 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 MZB1Q8WU39 189 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CCDC126Q96EE4 140 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ART5Q96L15 291 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CSF3RQ99062 836 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 WDR41Q9HAD4 459 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 MYOTQ9UBF9 498 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SNX6Q9UNH7 406 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ASB4Q9Y574 426 aa7.29□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 A0A1W2PR48 441 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 A8MUA0 341 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 C17orf105B2RV13 164 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 LDB3O75112 727 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ITGA10O75578 1167 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SLC25A12O75746 678 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ETHE1O95571 254 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 GPR75O95800 540 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 F10P00742 488 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 LDLRP01130 860 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 IGKV3-11P04433 115 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TNNI3P19429 210 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CCT5P48643 541 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SSR4P51571 173 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 NEK2P51955 445 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 PRKAA2P54646 552 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 RNF4P78317 190 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 PLIN5Q00G26 463 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CLCQ05315 142 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 RBPJQ06330 500 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 MPEG1Q2M385 716 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 METTL4Q8N3J2 472 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM156Q8N614 296 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SLC15A4Q8N697 577 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 NUBPLQ8TB37 319 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 NCLNQ969V3 563 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 FBXL20Q96IG2 436 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 FRMD6Q96NE9 622 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 CDK15Q96Q40 435 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF382Q96SR6 550 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM5B-208ENST00000491153 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms