RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PCDH17O14917 1159 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GABRB1P18505 474 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ENPP1P22413 925 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRATP43155 626 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C1DQ13901 141 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FGFBP1Q14512 234 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SNAPC1Q16533 368 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PAQR6Q6TCH4 344 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LIX1LQ8IVB5 337 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 WDFY2Q96P53 400 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM129BQ96TA1 746 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TCF25Q9BQ70 676 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 WACQ9BTA9 647 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ANKRA2Q9H9E1 313 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 STOML2Q9UJZ1 356 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MGAT4AQ9UM21 535 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ISM1B1AKI9 464 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LYRM1O43325 122 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRPS2P11908 318 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SRCP12931 536 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ACPPP15309 386 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LMAN2Q12907 356 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MICAQ29983 383 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 USP30Q70CQ3 517 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TAGAPQ8N103 731 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 UPRTQ96BW1 309 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TAPBPLQ9BX59 468 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ING4Q9UNL4 249 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 OR5K3A6NET4 321 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CSO75390 466 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RFPL3O75679 317 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 STK16O75716 305 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SEMG1P04279 462 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 EBLN1P0CF75 366 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NAGAP17050 411 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 EPORP19235 508 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ITGALP20701 1170 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 IL32P24001 234 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HSPA14Q0VDF9 509 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CERS6Q6ZMG9 384 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 COMMD7Q86VX2 200 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 AQP11Q8NBQ7 271 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HOXA2O43364 376 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SOX14O95416 240 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GPX2P18283 190 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 B4GALNT1Q00973 533 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZNB5 142 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PDZD3Q86UT5 571 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 IL21Q9HBE4 155 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CD84Q9UIB8 345 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 UNC80Q8N2C7 3258 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 H3BN98 237 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MTX2O75431 263 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HLA-EP13747 358 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DGKAP23743 735 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 AP1S1P61966 158 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GALEQ14376 348 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ANGPT1Q15389 498 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 P2RY14Q15391 338 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TEX261Q6UWH6 196 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 BTN2A2Q8WVV5 523 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMEM80Q96HE8 168 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CREBZFQ9NS37 354 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 U3KQ87 197 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 OBSL1O75147 1896 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SLC35F4A4IF30 521 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms