RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 TRBC2A0A5B9 178 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 LRIT2A6NDA9 550 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 SH3BP5O60239 455 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SEMA3DO95025 777 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 KRT75O95678 551 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ARAFP10398 606 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 HOXB2P14652 356 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 GABARAPL2P60520 117 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 RBBP4Q09028 425 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 IL18R1Q13478 541 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TP53BP2Q13625 1128 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 NPTX1Q15818 432 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RPE65Q16518 533 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 NUDT13Q86X67 352 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR8K5Q8NH50 307 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 APH1BQ8WW43 257 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TANKQ92844 425 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 AMBNQ9NP70 447 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0J9YVX5 310 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PGRMC2O15173 223 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SAXO2Q658L1 398 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 CCDC80Q76M96 950 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 LGI4Q8N135 537 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SETD9Q8NE22 299 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 FAR1Q8WVX9 515 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 MUL1Q969V5 352 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM19Q96HH6 336 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 MSRAQ9UJ68 235 aa8.43□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.43□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 A0A0A6YYD5 115 aa8.42□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 PRR19A6NJB7 356 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ADAMDEC1O15204 470 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 CCDC159P0C7I6 412 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 CTHP32929 405 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ACSL1P33121 698 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 MASP1P48740 699 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PRKAG1P54619 331 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 MLLT10P55197 1068 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 LIM2P55344 173 aa8.42□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RAB8AP61006 207 aa8.42□□□□□ -1.06
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