RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SYCE1L	A8MT33	242 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953		A8MUA0	341 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953		A8MVJ9	347 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC19A2	O60779	497 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SUPT3H	O75486	399 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	BANF1	O75531	89 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CELA2A	P08217	269 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SERPINB1	P30740	379 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CASQ1	P31415	396 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	STX2	P32856	288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PHB	P35232	272 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	RAP1GDS1	P52306	607 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC26A5	P58743	744 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	OLR1	P78380	273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	BTN3A2	P78410	334 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CDKL1	Q00532	357 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	ART3	Q13508	389 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TUBA3C	Q13748	450 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	XKR6	Q5GH73	641 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CCDC25	Q86WR0	208 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	OR56A3	Q8NH54	315 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	NT5C	Q8TCD5	201 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	ASB15	Q8WXK1	588 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	KIAA1191	Q96A73	305 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	REPS1	Q96D71	796 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	VMP1	Q96GC9	406 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CPNE1	Q99829	537 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	EXO5	Q9H790	373 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	HPF1	Q9NWY4	346 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	OARD1	Q9Y530	152 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	RELN	P78509	3460 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	STK16	O75716	305 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	MYO1D	O94832	1006 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CLDN1	O95832	211 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TUBB4A	P04350	444 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SP1	P08047	785 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	GSTA2	P09210	222 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CCDC166	P0CW27	439 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PCNA	P12004	261 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	HTR1E	P28566	365 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PPP2R1B	P30154	601 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CA7	P43166	264 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	KCNC1	P48547	511 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SSR4	P51571	173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PLA2G16	P53816	162 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	MTTP	P55157	894 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	HSD17B7	P56937	341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	REEP5	Q00765	189 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	IRF8	Q02556	426 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TEK	Q02763	1124 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SERTAD2	Q14140	314 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	PDK4	Q16654	411 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NCBP2-208	ENST00000455953	SPINK14	Q6IE38	97 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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