RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433383.1

NEK4P1-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P1, Length 879 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P1-201ENST00000433383 PIGRP01833 764 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 IFNA16P05015 189 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LINGO3P0C6S8 592 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 GSTT2P0CG29 244 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 GSTT2BP0CG30 244 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 STAG3L2P0CL84 134 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TNNI1P19237 187 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PTNP21246 168 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 CPT2P23786 658 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RPA1P27694 616 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 HTR2AP28223 471 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TEAD1P28347 426 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SERPINB1P30740 379 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 IFNA8P32881 189 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PCK1P35558 622 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PGM1P36871 562 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 GPR4P46093 362 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NPY4RP50391 375 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RAB9AP51151 201 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RAB28P51157 221 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 ARSEP51690 589 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 METAP1P53582 386 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 EMP2P54851 167 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 CDH8P55286 799 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LIPEQ05469 1076 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LRRC63Q05C16 580 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 CACNG1Q06432 222 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 ZNF33AQ06730 810 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MYBPHQ13203 477 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PCLAFQ15004 111 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PON2Q15165 354 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PON3Q15166 354 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 STX1AQ16623 288 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TIGD6Q17RP2 521 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 BCL7AQ4VC05 210 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LRRC38Q5VT99 294 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MLIPQ5VWP3 458 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 DUPD1Q68J44 220 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 KCTD11Q693B1 232 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 FUT10Q6P4F1 479 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TMEM270Q6UE05 265 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MTSS1LQ765P7 747 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 AMZ2Q86W34 360 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 CDK20Q8IZL9 346 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 OR2L3Q8NG85 312 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NDNFQ8TB73 568 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PDXPQ96GD0 296 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 APOPT1Q96IL0 206 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PRRC1Q96M27 445 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MGME1Q9BQP7 344 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 EDEM2Q9BV94 578 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 FICDQ9BVA6 458 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NUP58Q9BVL2 599 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 RAB17Q9H0T7 212 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 NAPBQ9H115 298 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 VCX2Q9H322 139 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 GID8Q9NWU2 228 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.4□□□□□ -1.87
NEK4P1-201ENST00000433383 ERAP1Q9NZ08 941 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms