RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 MAP2K4P45985 399 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 LIMS1P48059 325 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 C21orf59P57076 290 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 FGL2Q14314 439 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 CLCA4Q14CN2 919 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 SPCS2Q15005 226 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 CTF1Q16619 201 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 AHSA2Q719I0 299 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.01□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 APH1BQ8WW43 257 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 LHX9Q9NQ69 397 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 TAS2R7Q9NYW3 318 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 KCNK6Q9Y257 313 aa13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.01□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 GUCY1B2O75343 617 aa13□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 NTSP30990 170 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 SERPINB10P48595 397 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 MASP1P48740 699 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 ARFIP1P53367 373 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 RAB15P59190 212 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 OCA2Q04671 838 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 AQP6Q13520 282 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 COLEC12Q5KU26 742 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 C6orf120Q7Z4R8 191 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 DENND6BQ8NEG7 585 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 TANKQ92844 425 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 TMEM19Q96HH6 336 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 SIGLEC11Q96RL6 698 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 COPS4Q9BT78 406 aa13□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 DGKBQ9Y6T7 804 aa13□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 A0A1W2PQU0 124 aa12.99□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 NRTNQ99748 197 aa12.99□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.99□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 ABCG4Q9H172 646 aa12.99□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa12.99□□□□□ -0.33
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THBS3-202ENST00000428962 OR2A25A4D2G3 310 aa12.99□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 LRIT2A6NDA9 550 aa12.99□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 PRR23AA6NEV1 266 aa12.99□□□□□ -0.33
THBS3-202ENST00000428962 PDZK1P1A8MUH7 402 aa12.99□□□□□ -0.33
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