RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 AHSA1O95433 338 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF20P17024 532 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ASPNQ9BXN1 380 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CCRL2O00421 344 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ADRB3P13945 408 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GGT1P19440 569 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TREX1Q9NSU2 369 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM12O43184 909 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FHP07954 510 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 STSP08842 583 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF1BP20333 461 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C4BP0C0L5 1744 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0X1KG70 313 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DRGXA6NNA5 263 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EMC8O43402 210 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GP1BBP13224 206 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EPCAMP16422 314 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CHAF1BQ13112 559 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB41Q5JT25 222 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR150Q8NGU9 434 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 INPP5KQ9BT40 448 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR174Q9BXC1 333 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ABI3Q9P2A4 366 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 UPB1Q9UBR1 384 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GJB3O75712 270 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A1P23297 94 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CD83Q01151 205 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2L3Q8NG85 312 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF38Q9H0F5 515 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SARDHQ9UL12 918 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf226A1L170 272 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CSF2P04141 144 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR7G3Q8NG95 312 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RIT1Q92963 219 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HAVCR1Q96D42 359 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 IFT52Q9Y366 437 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ANHXE9PGG2 379 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FAAHO00519 579 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HPRP00739 348 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HLCSP50747 726 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MOAP1Q96BY2 351 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SHDQ96IW2 340 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 EHD1Q9H4M9 534 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-ND5P03915 603 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TFPTP0C1Z6 253 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MKLN1Q9UL63 735 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LIPT1Q9Y234 373 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CYB5AP00167 134 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CSTAP01040 98 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C7P10643 843 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CRISP1P54107 249 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf46Q504U0 113 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NETO1Q8TDF5 533 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MGLLQ99685 303 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC29A1Q99808 456 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CST11Q9H112 138 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms