RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389048.7

ALK-201, Transcript of ALK receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALK, Length 6,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALK-201ENST00000389048 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ICKQ9UPZ9 632 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RAD51DO75771 328 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ANXA3P12429 323 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 COMMD7Q86VX2 200 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 C12orf40Q86WS4 652 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PSAT1Q9Y617 370 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 LYPLA2O95372 231 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SHOXO15266 292 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ETV5P41161 510 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 YIPF1Q9Y548 306 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PCDH17O14917 1159 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC22A2O15244 555 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC19A2O60779 497 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TYRP14679 529 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PTPN6P29350 595 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OXTRP30559 389 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CCINQ13939 588 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ELP5Q8TE02 316 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 STMND1H3BQB6 276 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 IFNA5P01569 189 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 IL7P13232 177 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 IFNGR1P15260 489 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 NOGQ13253 232 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MOGQ16653 247 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 BCL9O00512 1426 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 STSP08842 583 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC2A5P22732 501 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AQP2P41181 271 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MAP4K2Q12851 820 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DYRK1AQ13627 763 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PTGR1Q14914 329 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ARL14Q8N4G2 192 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 NELL2Q99435 816 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 UNC119BA6NIH7 251 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AGPAT2O15120 278 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SQSTM1Q13501 440 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 THRSPQ92748 146 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SGCZQ96LD1 299 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OR5B12Q96R08 314 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SEC14L5O43304 696 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 KIAA0513O60268 411 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RBBP9O75884 186 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CAV3P56539 151 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FXYD4P59646 89 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.92□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OR6C6A6NF89 314 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PEX12O00623 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CHRNA1P02708 482 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 S1PR1P21453 382 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 F8A1P23610 371 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ETV3P41162 512 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 C1orf61Q13536 156 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HES5Q5TA89 166 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ELP2Q6IA86 826 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SDSLQ96GA7 329 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 A0A1W2PP18 115 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DFNA5O60443 496 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AGR2O95994 175 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CD3GP09693 182 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PRKACAP17612 351 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ADGRF1Q5T601 910 aa14.91□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms