RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 CDNFQ49AH0 187 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL4Q8N3J2 472 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ACER1Q8TDN7 264 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD17B14Q9BPX1 270 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MEIOCA2RUB1 952 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TLL1O43897 1013 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KRBOX4Q5JUW0 171 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CYS1Q717R9 158 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PMEPA1Q969W9 287 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CREG1O75629 220 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 T-ENOLP0DO92 83 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGFQ07326 219 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AKT2P31751 481 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RETREG3Q86VR2 466 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ESX1Q8N693 406 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PAGE1O75459 146 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RSU1Q15404 277 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FRG2Q64ET8 278 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFP90Q8TF47 636 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SMARCD2Q92925 531 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FRG2BQ96QU4 278 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATC1LQ9H0A9 340 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC32A1Q9H598 525 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OSER1Q9NX31 292 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXL3Q9UKT7 428 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNA1SQ13698 1873 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NPIPA5E9PKD4 350 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FFAR2O15552 330 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM12O43184 909 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ADRA1BP35368 520 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVK-25P63136 954 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SCGB2A2Q13296 93 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MSS51Q4VC12 460 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MAL2Q969L2 176 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR21Q99679 349 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NPIPA1Q9UND3 350 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKCHP24723 683 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD9Q7L273 389 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC43A2Q8N370 569 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF121Q9H920 327 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 INSIG1O15503 277 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RFC2P35250 354 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPA7P48741 367 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DGKQP52824 942 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ESCO2Q56NI9 601 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ACDQ96AP0 544 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C4AP0C0L4 1744 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C4BP0C0L5 1744 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CASRP41180 1078 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CHIT1Q13231 466 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CCL15Q16663 113 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM234Q8WY98 164 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DOHHQ9BU89 302 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCG5Q9H222 651 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35F4A4IF30 521 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC16A5O15375 505 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms